Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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