Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms