Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF6Q9BYE7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms