Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms