Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms