Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms