Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf16Q9BUW7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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