Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN18Q99952 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN18Q99952 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms