Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKP4Q99569 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PKP4Q99569 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKP4Q99569 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKP4Q99569 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms