Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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