Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYNGAP1Q96PV0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms