Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms