Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms