Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2E3Q969T4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms