Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKD2Q969F2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.7 ms