Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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GTF3C6Q969F1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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GTF3C6Q969F1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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GTF3C6Q969F1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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GTF3C6Q969F1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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GTF3C6Q969F1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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