Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEO1Q92859 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms