Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FBXO39Q8N4B4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FBXO39Q8N4B4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FBXO39Q8N4B4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FBXO39Q8N4B4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO39Q8N4B4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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