Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms