Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPPQ6IPU0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms