Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms