Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PDLIM3Q53GG5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms