Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MSMPQ1L6U9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms