Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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RTL8BQ17RB0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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