Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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