Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms