Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms