Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNIP1Q15025 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms