Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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