Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GRIN2CQ14957 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIN2CQ14957 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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