Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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