Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms