Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TCIRG1Q13488 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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