Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms