Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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