Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB40BQ12829 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms