Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TROQ12816 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TROQ12816 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TROQ12816 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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