Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TWF1Q12792 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TWF1Q12792 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TWF1Q12792 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TWF1Q12792 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TWF1Q12792 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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