Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAPQ12770 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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