Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms