Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms