Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SLFN5Q08AF3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms