Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms