Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms