Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms