Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms