Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms