Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms