Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB4BP68371 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms