Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms